Nature Methods 2021年12月文章目錄
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1.標(biāo)題:用于探索遺傳和藥物擾動(dòng)的3D結(jié)構(gòu)SARS-CoV-2-人類(lèi)相互作用組
簡(jiǎn)介:這種三維結(jié)構(gòu)的SARS-CoV-2-人類(lèi)相互作用組web server允許對(duì) SARS-CoV-2 病理學(xué)和宿主反應(yīng)的機(jī)制進(jìn)行假設(shè)驅(qū)動(dòng)的探索廷区。
作者:Shayne D. Wierbowski, Siqi Liang...Haiyuan Yu
原文鏈接:https://www.nature.com/articles/s41592-021-01318-w
圖:
Brief Communications
1.標(biāo)題:Micro-Meta App:一種基于comminity規(guī)范收集顯微鏡元數(shù)據(jù)的交互式工具
簡(jiǎn)介:Micro-Meta App 是一種直觀唯灵、高度可互操作的開(kāi)源軟件工具,旨在促進(jìn)最近c(diǎn)ommunity指南指定的相關(guān)顯微鏡元數(shù)據(jù)的提取和收集隙轻。
作者:Alessandro Rigano, Shannon Ehmsen...Caterina Strambio-De-Castillia
原文鏈接:https://www.nature.com/articles/s41592-021-01315-z
2.標(biāo)題:OME-NGFF:用于擴(kuò)展生物成像數(shù)據(jù)訪問(wèn)策略的下一代文件格式
簡(jiǎn)介:OME的下一代文件格式 (OME-NGFF) 為 OME-TIFF 和 HDF5 提供了云原生補(bǔ)充埠帕,用于大規(guī)模存儲(chǔ)和訪問(wèn)生物成像數(shù)據(jù),并致力于實(shí)現(xiàn)可查找玖绿、可訪問(wèn)敛瓷、可互操作和可重復(fù)使用的生物成像數(shù)據(jù)的目標(biāo)。
作者:Josh Moore, Chris Allan...Jason R. Swedlow
原文鏈接:https://www.nature.com/articles/s41592-021-01326-w
Articles
1.標(biāo)題:細(xì)菌基因調(diào)控的持久性和可塑性
簡(jiǎn)介:介紹了生物素-DNA 親和純化 (DAP) 測(cè)序斑匪,即一種用于分析轉(zhuǎn)錄因子 (TF) DNA 結(jié)合的體外無(wú)克隆工作流程呐籽,以及用于同時(shí)表征多個(gè)細(xì)菌基因組中TF DNA 結(jié)合的multiDAP。
作者:Leo A. Baumgart蚀瘸,Ji Eun Lee...Ronan C. O’Malley
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2.標(biāo)題:繪制單細(xì)胞水平細(xì)胞系統(tǒng)發(fā)育圖揭示器官發(fā)育過(guò)程中的細(xì)胞群體動(dòng)態(tài)
簡(jiǎn)介:SMALT 是一種堿基編輯譜系追蹤方法狡蝶,可在單細(xì)胞水平進(jìn)行全器官發(fā)育分析。
作者:Kehui Liu, Shanjun Deng...Xionglei He
3.標(biāo)題:使用pGlyco3對(duì)完整糖肽和修飾多糖進(jìn)行精確苍姜、快速和全面的分析
簡(jiǎn)介:pGlyco3是一種多糖優(yōu)先的糖肽搜索引擎牢酵,用于識(shí)別和定位位點(diǎn)特異性N-和O-糖肽,包括帶有修飾多糖的糖肽衙猪。
作者:Wen-Feng Zeng, Wei-Qian Cao...Peng-Yuan Yang
4.標(biāo)題:光譜熵在小分子化合物鑒定方面優(yōu)于MS/MS點(diǎn)積相似性
圖:
5.標(biāo)題:使用分級(jí)相襯層析成像技術(shù)對(duì)具有細(xì)胞結(jié)構(gòu)局部分辨率的完整人體器官進(jìn)行成像
簡(jiǎn)介:分級(jí)相襯層析成像(HiP-CT) 能夠?qū)ν暾梭w器官內(nèi)的任何區(qū)域進(jìn)行多尺度成像垫释,直至細(xì)胞分辨率丝格。五種器官類(lèi)型的HiP-CT揭示了健康和患病組織的3D形態(tài)特征。
作者:C. L. Walsh棵譬,P. Tafforeau...P. D. Lee
原文鏈接:https://www.nature.com/articles/s41592-021-01317-x
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6.標(biāo)題:使用改造黃熱病疫苗YFV-17D進(jìn)行順行跨神經(jīng)元追蹤和遺傳控制
簡(jiǎn)介:使用黃熱病疫苗YFV-17D的改造變體可以實(shí)現(xiàn)順行跨神經(jīng)元追蹤显蝌。單突觸和多突觸追蹤都在小鼠大腦的不同回路中得到證實(shí)。
作者:Elizabeth Li, Jun Guo...Wei Xu
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